Kegiatan pembelajaran di SD Kristen Makale 2 dilaksanakan dengan pendekatan yang aktif, kreatif, dan menyenangkan, sehingga setiap siswa dapat belajar sesuai dengan potensi dan gaya belajarnya masing-masing. Guru berperan sebagai fasilitator yang membimbing siswa untuk berpikir kritis, berani bertanya, dan berpartisipasi aktif dalam proses belajar. Pembelajaran tidak hanya berfokus pada hasil akademik, tetapi juga pada proses pengembangan karakter dan nilai-nilai Kristiani dalam setiap aktivitas di kelas.
Selain pembelajaran di ruang kelas, SD Kristen Makale 2 juga menerapkan kegiatan kokurikuler yang memperkaya pengalaman belajar siswa melalui proyek, kegiatan tematik, dan pembelajaran berbasis lingkungan. Siswa diajak untuk mengamati, meneliti, serta menerapkan ilmu pengetahuan dalam kehidupan nyata. Dengan demikian, mereka tidak hanya memahami teori, tetapi juga mampu menghubungkannya dengan situasi dan permasalahan di sekitar mereka.
Untuk mendukung pengembangan potensi secara menyeluruh, sekolah menyediakan berbagai kegiatan ekstrakurikuler seperti pramuka, marching band, paduan suara, dan seni tari Pa’gellu serta Pa’ Tirra khas Toraja. Melalui kegiatan ini, siswa dapat menyalurkan minat dan bakatnya sekaligus belajar disiplin, kerja sama, dan tanggung jawab. Seluruh kegiatan pembelajaran di SD Kristen Makale 2 dirancang untuk membentuk generasi yang unggul dalam prestasi, berkarakter Kristiani, dan memiliki kepedulian terhadap lingkungan.